Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atp8b5A3FIN4 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Atp8b5A3FIN4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp8b5A3FIN4 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms