Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Hivep3A2A884 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms