Protein–RNA interactions for Protein: V9GXR0

H2-Bl, Histocompatibility 2, blastocyst, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-BlV9GXR0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
H2-BlV9GXR0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
H2-BlV9GXR0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms