Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RfxankQ9Z205 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RfxankQ9Z205 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms