Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn13Q9Z0S4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn13Q9Z0S4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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