Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Cib1Q9Z0F4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Cib1Q9Z0F4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms