Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3bgrQ9WUZ7 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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