Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
TapbpQ9R233 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms