Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf4Q9QZS2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rnf4Q9QZS2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rnf4Q9QZS2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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