Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc4Q9QZD4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms