Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim44Q9QXA7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim44Q9QXA7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim44Q9QXA7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim44Q9QXA7 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Trim44Q9QXA7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trim44Q9QXA7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms