Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Trappc2lQ9JME7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc2lQ9JME7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms