Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Sfmbt1Q9JMD1 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms