Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tgm1Q9JLF6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tgm1Q9JLF6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tgm1Q9JLF6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tgm1Q9JLF6 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Tgm1Q9JLF6 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tgm1Q9JLF6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms