Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Habp4Q9JKS5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Habp4Q9JKS5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms