Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ccl28Q9JIL2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ccl28Q9JIL2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms