Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Wdr61Q9ERF3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms