Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms