Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Smg9Q9DB90 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms