Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pop5Q9DB28 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms