Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gtf3c6Q9D8P7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gtf3c6Q9D8P7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Fndc9-201ENSMUST00000060185 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gtf3c6Q9D8P7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gtf3c6Q9D8P7 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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