Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Srp19Q9D7A6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms