Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc9bQ9D6E4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ttc9bQ9D6E4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms