Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gpn3Q9D3W4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms