Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q9D2Q3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q9D2Q3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms