Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Trim42Q9D2H5 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Trim42Q9D2H5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Trim42Q9D2H5 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Trim42Q9D2H5 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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