Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Spns3Q9D232 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms