Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Syf2Q9D198 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms