Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gtf2e1Q9D0D5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms