Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Mms19Q9D071 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mms19Q9D071 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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