Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc47Q9D024 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc47Q9D024 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc47Q9D024 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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