Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CenpnQ9CZW2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms