Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Gins3Q9CY94 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms