Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Rpl11Q9CXW4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms