Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpusd4Q9CWX4 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms