Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
NubplQ9CWD8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms