Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Atxn3Q9CVD2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atxn3Q9CVD2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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