Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg12Q9CQY1 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms