Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atp5f1Q9CQQ7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Atp5f1Q9CQQ7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms