Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim8Q9CQQ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms