Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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Nicn1Q9CQM0 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Nicn1Q9CQM0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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