Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms