Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Prpf8Q99PV0 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Prpf8Q99PV0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms