Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Smim3Q99PE5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim3Q99PE5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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