Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
GpnmbQ99P91 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
GpnmbQ99P91 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms