Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tdrd1Q99MV1 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms