Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SrrtQ99MR6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 852.9 ms