Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rcbtb2Q99LJ7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rcbtb2Q99LJ7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms