Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RtcbQ99LF4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RtcbQ99LF4 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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