Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pacsin3Q99JB8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pacsin3Q99JB8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms